GSDS网站docker镜像本地构建的示例分析

这篇文章主要介绍GSDS网站docker镜像本地构建的示例分析，文中介绍的非常详细，具有一定的参考价值，感兴趣的小伙伴们一定要看完！

GSDS网站docker镜像本地构建

GSDS网站有时候打不开，可能服务器没有人维护，原网站：http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php 备用网站：http://gsds.gao-lab.org/index.php

这里为了方便大家使用GSDS，绘制基因结构图，组学大讲堂免费提供一个镜像使大家可以在自己的电脑上搭建一个GSDS网站，这样就永远不会打不开网站了，具体方法如下：

搭建网站系统环境：
操作系统：win10教育版，
docker：docker桌面版本

1.下载组学大讲堂提供的专门为GSDS定制的docker镜像

> docker search omicsclass   #搜索镜像
NAME                           DESCRIPTION                                     STARS               OFFICIAL            AUTOMATED
omicsclass/gene-family         gene-family analysis docker image               4
omicsclass/rnaseq              RNA-seq analysis docker image build by omics…   3
omicsclass/reseq               whole genome resequence analysis                1
omicsclass/blast-plus          blast+ v2.9.0                                   0
omicsclass/biocontainer-base   Biocontainers base Image centos7                0
omicsclass/isoseq3             isoseq3 v3.3.0 build by omicsclass              0
omicsclass/bwa                 BWA v0.7.17 build by omicsclass                 0
omicsclass/samtools            samtools v1.10 build by omicsclass              0
omicsclass/blastall            legacy blastall v2.2.26                         0
omicsclass/sratoolkit          SRAtoolkit v2.10.3 and aspera v3.9.9.177872     0
omicsclass/ampliseq-q2         Amplicon sequencing qiime2 v2020.2 image        0
omicsclass/bsaseq              NGS Bulk Segregant Analysis image               0
omicsclass/ampliseq-q1         Amplicon sequencing qiime1 v1.9.1 image         0
omicsclass/gwas                gwas analysis images                            0

> docker pull omicsclass/gsds-v2  #下载镜像

2.下载GSDS网站源代码下载：gsds_v2.zip ，然后解压文件到一个目录：

我这里解压到了：D:\gsds_v2

3.启动docker镜像：

>     #查看后台镜像
REPOSITORY               TAG                 IMAGE ID            CREATED             SIZE
omicsclass/gsds-v2       latest              d77e054c3744        8 hours ago         2.54GB
mattrayner/lamp          latest              05750cfa54d5        5 days ago          915MB
omicsclass/bsaseq        latest              d5ed7a70bfc8        13 days ago         9.77GB
omicsclass/reseq         v1.1                da154448a90f        4 weeks ago         8.83GB
omicsclass/gene-family   v1.0                2d1d640726dd        3 months ago        4.53GB
>          #后台启动docker网站服务器，注意目录映射-v 参数， 解压的目录D:\gsds_v2