支付宝商户版和个人版的区别如下：

1、商户版是以公司名义实名认证，需要公司相关证件才可以；个人版是以个人名字实名认证，提供的是个人身份信息；

2、企业支付宝增回加交易管理、财务管理、批量资金结算服务等功能，更加智能化的交易账务数据下载、批量收答付款、语音支付等服务，让支付宝账户使用更加便捷，安全。